Ingénieur Bioinformaticien en Bioinformatique Clinique (H/F)
Institut Curie
Paris
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CDD
ParisIngénieur Bioinformaticien en Bioinformatique Clinique (H/F)
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Paramédical* Ensemble hospitalier
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L'Institut Curie recrute un(e) Ingénieur(e) Bioinformaticien dans le cadre d'un CDD de 6 mois au sein de l’unité de Bioinformatique Clinique incluse dans le Pôle de Médecine Diagnostique et Théranostique. Le poste est à pourvoir à partir de Novembre 2026\.
Principales activités :
- Réécriture / optimisation de pipelines d’analyses avec mise en place de conteneurs et de tests unitaires, jeux de validation
- Développement d’outils spécifiques au diagnostic clinique avec recherche bibliographique, évaluation d’outils publiés, mise en place d’approches originales
- Participation à l’analyse de projets de recherche associés à des essais cliniques
- Présentation régulière des avancées aux différents collaborateurs notamment l’IC
- Contribution à différentes publications associées aux données analysées / aux nouvelles approches mises en place
- Une formation dès votre arrivée
- CE avantageux, remboursement des frais de transport jusqu'à 75%, restaurant d'entreprise
- Rémunération entre 3 254€ et 3 524€ brut mensuel
- Poste basé à Paris 75005 \- RER B (Luxembourg)
Compétences requises :
- Maîtriser l’environnement linux
- Maîtriser au moins l’un des langages de programmation suivants (idéalement avoir de l’expérience sur plusieurs d’entre eux) : python, java ou autre langage orienté objet
- Maîtriser le langage de programmation R
- Bonnes connaissances des outils standards de bioinformatique pour l’analyse et l'interprétation des données de séquençage haut\-débit (DNA, RNA, méthylation)
- Bonne connaissance des méthodes statistiques (machine learning / deep learning, outils supervisés et non supervisés)
- Avoir un attrait pour les interactions avec les biologistes
- Rigueur, dynamisme, capacité à travailler en autonomie
- Excellent esprit d’équipe
- Bonnes connaissances en algorithmique
- Versionnage du code avec GIT
- Maîtrise de l’anglais technique et scientifique à l’oral et à l’écrit
- Des compétences dans l’un ou plusieurs domaines suivants seraient un gros plus : utilisation de cluster de calcul (SGE / SLURM / LSF / MOAB, etc.), expérience en calcul distribué, utilisation de GPU, expérience en machine learning / deep learning, utilisation de gestionnaire de workflow type Nextflow / snakemake, classification supervisée et non supervisée, réduction de dimensions, conteneurisation (singularity / docker)
- Des connaissances en oncologie sont un plus
- Etre titulaire d’un Doctorat ou d'un Diplôme d'Ingénieur en Bioinformatique
- Une première expérience en analyses de données NGS est souhaitée
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